Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc8Q9CYA6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc8Q9CYA6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zcchc8Q9CYA6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zcchc8Q9CYA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zcchc8Q9CYA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zcchc8Q9CYA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc8Q9CYA6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 620.9 ms