Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChtopQ9CY57 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChtopQ9CY57 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChtopQ9CY57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChtopQ9CY57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChtopQ9CY57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChtopQ9CY57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms