Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl11Q9CXW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl11Q9CXW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl11Q9CXW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl11Q9CXW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl11Q9CXW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms