Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cxxc1Q9CWW7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxxc1Q9CWW7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxxc1Q9CWW7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxxc1Q9CWW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cxxc1Q9CWW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxxc1Q9CWW7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms