Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Khdc3Q9CWU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Khdc3Q9CWU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Khdc3Q9CWU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Khdc3Q9CWU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Khdc3Q9CWU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Khdc3Q9CWU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Khdc3Q9CWU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms