Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVN6

Cby3, Protein chibby homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby3Q9CVN6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cby3Q9CVN6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cby3Q9CVN6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cby3Q9CVN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cby3Q9CVN6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cby3Q9CVN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cby3Q9CVN6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cby3Q9CVN6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms