Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atxn3Q9CVD2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atxn3Q9CVD2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atxn3Q9CVD2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Atxn3Q9CVD2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atxn3Q9CVD2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atxn3Q9CVD2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Atxn3Q9CVD2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atxn3Q9CVD2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atxn3Q9CVD2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms