Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
2310003L06RikQ9CV82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
2310003L06RikQ9CV82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
2310003L06RikQ9CV82 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
2310003L06RikQ9CV82 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2310003L06RikQ9CV82 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
2310003L06RikQ9CV82 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
2310003L06RikQ9CV82 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms