Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lhfpl3Q9CTN8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms