Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm7sf3Q9CRG1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm7sf3Q9CRG1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm7sf3Q9CRG1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm7sf3Q9CRG1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm7sf3Q9CRG1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm7sf3Q9CRG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm7sf3Q9CRG1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm7sf3Q9CRG1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm7sf3Q9CRG1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm7sf3Q9CRG1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms