Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029F12RikQ9CRB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029F12RikQ9CRB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029F12RikQ9CRB4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms