Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB0

Snx24, Sorting nexin-24, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx24Q9CRB0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Snx24Q9CRB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Snx24Q9CRB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Snx24Q9CRB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Snx24Q9CRB0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Snx24Q9CRB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Snx24Q9CRB0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Snx24Q9CRB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Snx24Q9CRB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Snx24Q9CRB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Snx24Q9CRB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Snx24Q9CRB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Snx24Q9CRB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Snx24Q9CRB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Snx24Q9CRB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Snx24Q9CRB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms