Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc43Q9CR29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc43Q9CR29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc43Q9CR29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc43Q9CR29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc43Q9CR29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc43Q9CR29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms