Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mri1Q9CQT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mri1Q9CQT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mri1Q9CQT1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mri1Q9CQT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mri1Q9CQT1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mri1Q9CQT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mri1Q9CQT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mri1Q9CQT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms