Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed6Q9CQG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed6Q9CQG0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed6Q9CQG0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed6Q9CQG0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed6Q9CQG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed6Q9CQG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms