Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab5aQ9CQD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab5aQ9CQD1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab5aQ9CQD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab5aQ9CQD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab5aQ9CQD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab5aQ9CQD1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms