Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ88

Tspan31, Tetraspanin-31, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan31Q9CQ88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan31Q9CQ88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan31Q9CQ88 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan31Q9CQ88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan31Q9CQ88 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan31Q9CQ88 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan31Q9CQ88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan31Q9CQ88 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Tspan31Q9CQ88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan31Q9CQ88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan31Q9CQ88 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tspan31Q9CQ88 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tspan31Q9CQ88 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tspan31Q9CQ88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan31Q9CQ88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan31Q9CQ88 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1218.8 ms