Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rpa3Q9CQ71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rpa3Q9CQ71 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rpa3Q9CQ71 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Rpa3Q9CQ71 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rpa3Q9CQ71 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,89■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rpa3Q9CQ71 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rpa3Q9CQ71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rpa3Q9CQ71 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms