Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930519G04RikQ9CPT7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930519G04RikQ9CPT7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930519G04RikQ9CPT7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930519G04RikQ9CPT7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930519G04RikQ9CPT7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms