Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt23Q99PS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt23Q99PS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt23Q99PS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt23Q99PS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt23Q99PS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt23Q99PS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Krt23Q99PS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Krt23Q99PS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt23Q99PS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt23Q99PS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt23Q99PS0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt23Q99PS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt23Q99PS0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms