Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcg5Q99PE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcg5Q99PE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcg5Q99PE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcg5Q99PE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcg5Q99PE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcg5Q99PE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg5Q99PE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcg5Q99PE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms