Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab27bQ99P58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab27bQ99P58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab27bQ99P58 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab27bQ99P58 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab27bQ99P58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab27bQ99P58 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms