Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Krt84Q99M73 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Krt84Q99M73 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Krt84Q99M73 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Krt84Q99M73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Krt84Q99M73 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt84Q99M73 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt84Q99M73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt84Q99M73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt84Q99M73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt84Q99M73 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt84Q99M73 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krt84Q99M73 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt84Q99M73 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt84Q99M73 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms