Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PsphQ99LS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PsphQ99LS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PsphQ99LS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PsphQ99LS3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PsphQ99LS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PsphQ99LS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PsphQ99LS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PsphQ99LS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms