Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf34Q99KR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rnf34Q99KR6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf34Q99KR6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf34Q99KR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf34Q99KR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf34Q99KR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf34Q99KR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf34Q99KR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf34Q99KR6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf34Q99KR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf34Q99KR6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf34Q99KR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms