Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab28Q99KL7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab28Q99KL7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab28Q99KL7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab28Q99KL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rab28Q99KL7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab28Q99KL7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab28Q99KL7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab28Q99KL7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab28Q99KL7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab28Q99KL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab28Q99KL7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab28Q99KL7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms