Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfxn4Q925N1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfxn4Q925N1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfxn4Q925N1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfxn4Q925N1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfxn4Q925N1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfxn4Q925N1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfxn4Q925N1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfxn4Q925N1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfxn4Q925N1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfxn4Q925N1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms