Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PdgfdQ925I7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PdgfdQ925I7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PdgfdQ925I7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PdgfdQ925I7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PdgfdQ925I7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PdgfdQ925I7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PdgfdQ925I7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PdgfdQ925I7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PdgfdQ925I7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PdgfdQ925I7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PdgfdQ925I7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PdgfdQ925I7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PdgfdQ925I7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PdgfdQ925I7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms