Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atad3Q925I1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atad3Q925I1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atad3Q925I1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atad3Q925I1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atad3Q925I1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad3Q925I1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atad3Q925I1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad3Q925I1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad3Q925I1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad3Q925I1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad3Q925I1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms