Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply3Q924S9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripply3Q924S9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripply3Q924S9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripply3Q924S9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ripply3Q924S9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ripply3Q924S9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms