Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp4Q921I6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp4Q921I6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp4Q921I6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp4Q921I6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp4Q921I6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms