Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Odf3Q920N1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf3Q920N1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Odf3Q920N1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf3Q920N1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf3Q920N1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms