Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csdc2Q91YQ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csdc2Q91YQ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csdc2Q91YQ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csdc2Q91YQ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms