Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhac1Q91Y10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac1Q91Y10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac1Q91Y10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhac1Q91Y10 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhac1Q91Y10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhac1Q91Y10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhac1Q91Y10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms