Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx11Q91WL6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx11Q91WL6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx11Q91WL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx11Q91WL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx11Q91WL6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx11Q91WL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx11Q91WL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms