Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp3Q91W36 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp3Q91W36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp3Q91W36 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp3Q91W36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp3Q91W36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp3Q91W36 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp3Q91W36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp3Q91W36 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms