Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Col26a1Q91VF6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col26a1Q91VF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col26a1Q91VF6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col26a1Q91VF6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col26a1Q91VF6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Col26a1Q91VF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col26a1Q91VF6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col26a1Q91VF6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col26a1Q91VF6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms