Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn8Q91VA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn8Q91VA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn8Q91VA3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn8Q91VA3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn8Q91VA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn8Q91VA3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn8Q91VA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn8Q91VA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn8Q91VA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn8Q91VA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn8Q91VA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms