Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ8

Nprl3, GATOR complex protein NPRL3, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nprl3Q8VIJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nprl3Q8VIJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nprl3Q8VIJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nprl3Q8VIJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nprl3Q8VIJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nprl3Q8VIJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nprl3Q8VIJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nprl3Q8VIJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms