Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Ppargc1bQ8VHJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Ppargc1bQ8VHJ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Ppargc1bQ8VHJ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Ppargc1bQ8VHJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Ppargc1bQ8VHJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3,19
Ppargc1bQ8VHJ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35■■■■□ 3,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms