Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED9

Lgalsl, Galectin-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgalslQ8VED9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
LgalslQ8VED9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
LgalslQ8VED9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,91
LgalslQ8VED9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
LgalslQ8VED9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
LgalslQ8VED9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,52■□□□□ 0,88
LgalslQ8VED9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
LgalslQ8VED9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,44■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20,43■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
LgalslQ8VED9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,7 ms