Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TgdsQ8VDR7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TgdsQ8VDR7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TgdsQ8VDR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TgdsQ8VDR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TgdsQ8VDR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TgdsQ8VDR7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TgdsQ8VDR7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms