Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam20bQ8VCS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam20bQ8VCS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam20bQ8VCS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam20bQ8VCS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam20bQ8VCS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20bQ8VCS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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