Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh10Q8VCH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh10Q8VCH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rdh10Q8VCH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh10Q8VCH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh10Q8VCH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rdh10Q8VCH7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh10Q8VCH7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms