Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clptm1Q8VBZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clptm1Q8VBZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clptm1Q8VBZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clptm1Q8VBZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clptm1Q8VBZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clptm1Q8VBZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clptm1Q8VBZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clptm1Q8VBZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms