Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RttnQ8R4Y8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms