Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a8Q8R4D1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a8Q8R4D1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a8Q8R4D1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a8Q8R4D1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a8Q8R4D1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms