Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp4Q8R2N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp4Q8R2N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Utp4Q8R2N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utp4Q8R2N2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp4Q8R2N2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp4Q8R2N2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp4Q8R2N2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp4Q8R2N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms