Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Treml1Q8K558 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Treml1Q8K558 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml1Q8K558 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Treml1Q8K558 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Treml1Q8K558 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml1Q8K558 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms