Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolbQ8K409 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolbQ8K409 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolbQ8K409 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PolbQ8K409 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PolbQ8K409 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolbQ8K409 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PolbQ8K409 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolbQ8K409 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PolbQ8K409 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolbQ8K409 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolbQ8K409 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolbQ8K409 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms